Nog tijdens de lopende missie in voormalig Joegoslavië ontstond in 1998 een nieuwconflict tussen Kosovo en Servië. Dat leidde tot de inzet van NAVO-grondtroepen enbombardementen waaraan Nederland ook deelnam. In juni 1999 werd een staakt-het-vurenafgekondigd en trok vredesmacht KFOR binnen in Kosovo. Nederland zette ruim 5.000militairen in waarvan er een om het leven kwam.Nederland zette in juni 1999 - in de Adriatische Zee - ook de onderzeeboot Hr. Ms. Dolfijnin. De Serviërs hadden zich namelijk bij het uiteenvallen van Joegoslavië meester gemaaktvan de Kroatische vloot, inclusief onderzeeboten van het type Sava en Heroj. Deze uiterstgeheime operatie had onder andere tot doel het uitschakelen daarvan, indien nodig. Met deDolfijn werden 58 bemanningsleden ingezet.
